Asal Coronavirus: Analisis Genom Mencadangkan Dua Virus Mungkin Bergabung

Imej melalui Michal Ico / Unsplash

memukul pada tahap kesakitan bola

Artikel oleh Alexandre Hassanin ini diterbitkan semula di sini dengan izin dari Perbualan . Kandungan ini dikongsi di sini kerana topik ini mungkin menarik minat pembaca Snopes, namun tidak mewakili karya penyemak fakta atau editor Snopes.




Dalam beberapa minggu, kita semua telah belajar banyak perkara mengenai COVID-19 dan virus yang menyebabkannya: SARS-CoV-2. Tetapi terdapat juga banyak khabar angin. Dan sementara jumlah artikel ilmiah mengenai virus ini semakin meningkat, masih banyak kawasan abu-abu mengenai asal usulnya.



Di mana spesies haiwan itu berlaku? Kelawar, pangolin atau spesies liar lain? Dari mana asalnya? Dari sebuah gua atau hutan di wilayah China Hubei, atau di tempat lain?

Pada bulan Disember 2019, 27 daripada 41 orang pertama yang dimasukkan ke hospital (66%) melalui pasar yang terletak di tengah-tengah bandar Wuhan di wilayah Hubei. Tetapi, menurut a kajian yang dijalankan di Hospital Wuhan , kes manusia pertama yang dikenal pasti tidak kerap berlaku di pasaran ini. Sebaliknya, anggaran temu janji molekul berdasarkan urutan genom SARS-CoV-2 menunjukkan asal pada bulan November. Ini menimbulkan persoalan mengenai kaitan antara wabak COVID-19 ini dan hidupan liar.



Data genom

The Genom SARS-CoV-2 dengan cepat disusun oleh penyelidik Cina. Ia adalah RNA molekul kira-kira 30,000 pangkalan yang mengandungi 15 gen, termasuk gen S yang memberi kod untuk protein yang terletak di permukaan sampul virus (untuk perbandingan, genom kita adalah dalam bentuk heliks ganda DNA berukuran sekitar 3 bilion pangkalan dan mengandungi kira-kira 30,000 gen).

Perbandingan analisis genom telah menunjukkan bahawa SARS-CoV-2 tergolong dalam kumpulan Betacoronavirus dan ia sangat dekat SARS-CoV , bertanggung jawab atas wabak pneumonia akut yang muncul pada bulan November 2002 di wilayah China di Guangdong dan kemudian merebak ke 29 negara pada tahun 2003. Sebanyak 8,098 kes direkodkan, termasuk 774 kematian. Telah diketahui bahawa kelawar genus Rhinolophus (berpotensi beberapa spesies gua) adalah takungan virus ini dan bahawa karnivor kecil, musang sawit ( Paguma larvata , mungkin telah berfungsi sebagai tuan rumah perantaraan antara kelawar dan kes manusia pertama.

Sejak itu, banyak Betacoronavirus telah ditemui, terutama pada kelawar, tetapi juga pada manusia. Contohnya, RaTG13, diasingkan dari kelawar spesies Berkaitan dengan Rhinolophidae dikumpulkan di Provinsi Yunan China, baru-baru ini digambarkan sangat mirip dengan SARS-CoV-2, dengan urutan genom sama dengan 96% . Hasil ini menunjukkan bahawa kelawar, dan spesies genus tertentu Rhinolophus , merupakan takungan virus SARS-CoV dan SARS-CoV-2.



Satu, Rhinolophidae berkaitan .
Alexandre Hassanin,Pengarang disediakan

Tetapi bagaimana anda menentukan takungan? Suatu takungan adalah satu atau beberapa spesies haiwan yang tidak sensitif atau tidak terhadap virus, yang secara semula jadi akan menampung satu atau beberapa virus. Ketiadaan gejala penyakit ini dijelaskan oleh keberkesanan sistem imun mereka, yang memungkinkan mereka untuk melawan percambahan virus yang terlalu banyak.

Mekanisme pengumpulan semula

Pada 7 Februari 2020, kami mengetahui bahawa virus yang lebih dekat dengan SARS-CoV-2 telah dijumpai di pangolin. Dengan 99% daripada kesesuaian genomik dilaporkan , ini menunjukkan takungan yang lebih mungkin daripada kelawar. Walau bagaimanapun, a kajian terbaru yang dikaji menunjukkan bahawa genom coronavirus diasingkan dari pangolin Malaysia ( Manis javanica kurang serupa dengan SARS-Cov-2, dengan hanya 90% kesesuaian genom. Ini akan menunjukkan bahawa virus yang terisolasi dalam pangolin tidak bertanggungjawab terhadap wabak COVID-19 yang sedang marak.

Walau bagaimanapun, coronavirus yang diasingkan dari pangolin serupa pada 99% di kawasan tertentu protein S, yang sepadan dengan 74 asid amino yang terlibat dalam domain pengikat reseptor ACE (Angiotensin Converting Enzyme 2), yang membolehkan virus masuk sel manusia untuk menjangkiti mereka. Sebaliknya, virus RaTG13 diasingkan dari kelawar R. berkaitan sangat berbeza di kawasan khusus ini (hanya 77% kesamaan). Ini bermaksud bahawa coronavirus yang diasingkan dari pangolin mampu memasuki sel manusia sedangkan yang diasingkan dari kelawar R. berkaitan tidak.

pemilik perniagaan florida terlibat dalam pertempuran dengan penjarah

Sebagai tambahan, perbandingan genomik ini menunjukkan bahawa virus SARS-Cov-2 adalah hasil penggabungan antara dua virus yang berbeza, satu dekat dengan RaTG13 dan yang lain lebih dekat dengan virus pangolin. Dengan kata lain, ia adalah chimera antara dua virus yang sudah ada.

Coronavirus dari pangolin dapat menjadi salah satu sumber COVID-19.
Perikatan Hidupan Liar / Flickr , CC OLEH

Mekanisme pengumpulan semula ini mempunyai sudah digambarkan dalam coronavirus, khususnya untuk menjelaskan asal usul SARS-CoV. Penting untuk diketahui bahawa pengumpulan semula menghasilkan virus baru yang berpotensi menjangkiti spesies inang baru. Agar pengumpulan semula berlaku, kedua-dua virus yang berbeza mesti menjangkiti organisma yang sama secara serentak.

menyatakan dengan umur persetujuan 16

Dua soalan masih belum dijawab: di mana organisma penggabungan ini berlaku? (kelawar, pangolin atau spesies lain?) Dan di atas semua, di bawah keadaan apa penggabungan ini berlaku?


Alexandre Hassanin , Profesor Madya (HDR) di Universiti Sorbonne, ISYEB - Institute of Systematics, Evolution, Biodiversity (CNRS, MNHN, SU, EPHE, UA), Muzium Sejarah Alam Negara (MNHN)

Artikel ini diterbitkan semula dari Perbualan di bawah lesen Creative Commons. Membaca artikel asal .